侵害配偶權能否只告配偶或只告第三者？

可以。
民事訴訟的提告對象可由當事人自行選擇。

若今天老公出軌，身為妻子的小花可以：
1. 對老公及小三提告
2. 只對小三提告
3. 只對老公提告

在小花選擇2或3之後，認為另一方也應該負起責任時，可追加另一位被告。